Diplôme Licence professionnelle Sciences, technologie, santé mention bio-industries et Biotechnologies parcours Bio-informatique
Objectifs pédagogiques
- Être initié aux problématiques bio-informatiques liées à l'émergence des nouvelles biotechnologies
- Connaître les moyens pour utiliser les logiciels existants sur le Web qui permettent déjà de traiter de manière puissante les données biologiques générées par les nouvelles biotechnologies (bases de données, logiciels de traitement de séquence, logiciels statistiques)
- Maîtriser les bases du développement informatique (langages Scheme, Java, R et Python) pour solutionner les problématiques posées par les nouvelles biotechnologies (développement et déploiement d'applications et intégration de logiciels) du type des analyses génomiques ou protéomiques.
- Réaliser un programme bio-informatique dans le cadre d’un stage de 3 à 6 mois, effectué au sein d’un laboratoire de recherche ou d’une plateforme d’analyse bio-informatique, stage constituant un véritable tremplin vers le monde professionnel.
- Niveau d'entrée :
- Bac + 2
- Niveau de sortie :
- Bac + 3, Bac + 4
- ECTS :
- 60
- Déployabilité
- A la carte : Formation pouvant s'effectuer au rythme de l'élève, en s'inscrivant aux unités du cursus
- Formation initiale : Formation pouvant être suivi par des étudiants
- Package : Formation pouvant se suivre en s'inscrivant à un "package" (groupe d'enseignements indissociables)
Compétences et débouchés
Dans le cadre de ces structures et missions, il développe ses capacités et compétences dans les fonctions suivantes où il se montre capable de :
- appliquer des méthodes d'analyse et de diagnostic des besoins clients (analyse de la valeur, groupes d'usagers...) et créer un projet correspondant à cette demande (prédiction de gènes, création d'un logiciel),
- gérer les données de biologie moléculaire et cellulaire à partir des protocoles mis en place (application de la génomique structurale et fonctionnelle),
- participer à la conception de nouveaux outils informatiques destinés à l'analyse in silico (prédiction de gènes, de structures, d'interactions...), à l'analyse de données d'expression (transcriptome, protéome...) et à la modélisation de processus cellulaires et réseaux moléculaires),
- intégrer des sources hétérogènes dans les bases de données (nomenclature, analyse de textes,ontologies...),
- développer des applications spécifiques (installation, paramétrage et diffusion d'applications généralistes),
- diffuser et mettre à jour des banques de données en repérant les redondances et complémentarités des données et en gérant leur cohérence,
- développer des interfaces utilisateurs pour l'aide à l'analyse et à l'extraction des connaissances,
- assurer une veille technique portant sur l'évolution des biotechnologies et des
réglementations du secteur (création d'une liste documentaire et de rapports ou de synthèses documentaires sur des sujets scientifiques, application des méthodes de recherche bibliographique, rédaction de documents techniques en anglais et en français, organisation de la diffusion de cette veille à partir des intranets et des circuits de production et de recherche externes).
Méthodes pédagogiques
Les enseignements théoriques, couplés à des mises en application en travaux dirigés et travaux pratiques sur matériels et logiciels métiers permettront une professionnalisation rapide. L'espace numérique de formation du Cnam (Moodle) permet à chaque enseignant de rendre accessible des ressources spécifiques à ses enseignements. Des modalités plus détaillées seront communiquées au début de chaque cours.
Modalités de validation
Examens écrits, oraux et pratiques durant l'année, puis soutenance devant un jury mixte constitué d'enseignants du CNAM et de professionnels.
Prérequis et conditions d'accès
Prérequis :
Titulaires d'un diplôme de type Bac+2 dans la biologie/biochimie et qui, à cause des progrès des biotechnologies, sont aujourd'hui quotidiennement confrontés à la Bio-informatique sans l'avoir jamais apprise.
Les enseignements dispensés leur permettront de gérer au mieux l'évolution actuelle de leur métier.
Les étudiants ayant une formation de type L1/L2 pourront s'inscrire en licence professionnelle de bio-informatique si leur profil est équivalent à celui des traditionnels Bac+2 en biologie/biochimie.
Ils devront avoir reçu l'équivalent d'une formation de base en Biochimie (au moins 60 heures) et en biologie cellulaire et moléculaire (au moins 60 heures).
Exigence du programme
Compétences attestées :
Compétences transversales
- Utiliser les outils numériques de référence et les règles de sécurité informatique pour acquérir, traiter, produire et diffuser de l’information ainsi que pour collaborer en interne et en externe
- Identifier et sélectionner avec esprit critique diverses ressources dans son domaine de spécialité pour documenter un sujet
- Analyser et synthétiser des données en vue de leur exploitation
- Développer une argumentation avec esprit critique
- Se servir aisément des différents registres d’expression écrite et orale de la langue française
- Communiquer par oral et par écrit, de façon claire et non ambiguë, dans au moins une langue étrangère
- Identifier et situer les champs professionnels potentiellement en relation avec les acquis de la mention ainsi que les parcours possibles pour y accéder
- Caractériser et valoriser son identité, ses compétences et son projet professionnel en fonction d’un contexte
- Identifier le processus de production, de diffusion et de valorisation des savoirs
- Situer son rôle et sa mission au sein d'une organisation pour s’adapter et prendre des initiatives
- Travailler en équipe et en réseau ainsi qu’en autonomie et responsabilité au service d’un projet
- Analyser ses actions en situation professionnelle, s’autoévaluer pour améliorer sa pratique
- Respecter les principes d’éthique, de déontologie et de responsabilité sociale et environnementale
- Prendre en compte la problématique du handicap et de l'accessibilité dans chacune de ses actions professionnelles
Compétences spécifiques de la mention
- Effectuer les analyses en laboratoire des différents secteurs professionnels (telles que des analyses biologiques, biochimiques, microbiologiques, histologiques, sensorielles, rhéologiques, physico-chimiques …)
- Analyser les échantillons et l'environnement (conformité, activité, dénombrements microbiologiques...) en utilisant les des techniques d'instrumentation et de caractérisation appropriées (conformité, activité, dénombrements microbiologiques...)
- Vérifier la qualité des matières premières, des produits intermédiaires et des produits finis dans diverses industries (pharmaceutique, agroalimentaire, cosmétique…) par des tests et des analyses adéquats
- Participer à des projets visant à développer de nouveaux produits, matériaux ou technologies
- Assurer la sécurité des données, leur conformité par rapport aux référentiels et aux normes, leur qualité, leur traçabilité, ainsi que leur présentation
- Mettre en œuvre des protocoles de sécurité en laboratoire/industrie vis-à-vis notamment des risques chimiques et biologiques et veiller à ce que les règles de manipulation des produits soient respectées
- Respecter les réglementations, notamment celles adaptées aux entreprises pharmaceutiques, aux laboratoires d'analyses, à la radioactivité, à l’expérimentation animale... ainsi que les normes d'hygiène et sécurité et de la démarche qualité
- Établir un cahier des charges permettant l’optimisation des activités en relation avec les fournisseurs, les sous-traitants…
- Mettre en place les procédures de production/de R et D/de contrôle qualité en tenant compte des équipements, des unités de production (biofermenteurs, culture cellulaire...) et de l’organisation des équipes
- Assurer un appui technique aux services production, qualité, maintenance, etc.
- Organiser et coordonner des projets de fabrication ou d'industrialisation
- Réaliser l'entretien, la calibration, la qualification et le suivi métrologique des instruments de laboratoire, tels que les spectromètres, les chromatographes, les bioréacteurs, les microscopes, les micropipettes...
- Valider des méthodes d'analyse en suivant des protocoles et des normes établis
- Assurer le suivi de la conformité aux réglementations et aux normes d'hygiène et sécurité
Dans certains établissements, d'autres compétences spécifiques peuvent permettre de décliner, préciser ou compléter celles proposées dans le cadre de la mention au niveau national.
Pour en savoir plus se reporter au site de l'établissement.
Mentions officielles
Le certificateur est le Cnam
- Code RNCP
- 40411
- Date d'enregistrement au RNCP
- Date de l'échéance de l'enregistrement au RNCP
Modalités et délais d'accès
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Équivalences, passerelles & suite de parcours
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Débouchés (Codes ROME)
- Bioinformaticien / Bioinformaticienne en études, recherche et développement[H1206]
- Statistique
- Bioinformatique
- Biologie
- Biotechnologie
- Génétique
- Informatique scientifique
- Logiciel statgraphics
Informations complémentaires
Fiche synthétique non disponible
Modules d'enseignement
Blocs de compétences
Un bloc de compétences est constitué d'un ensemble d'Unités qui répond aux besoins en formation de l'intitulé du bloc.
Les unités ci-dessus sont réparties dans les Blocs de compétences ci-dessous.
Chaque bloc de compétences peut être validé séparément.
Information non disponible, pour plus d'information veuillez contacter le Cnam